Dr Cristina Sisu
Senior Lecturer in Genomic Data Analytics
- Biosciences
Kerslake, R., Sisu, C., Panfilov, S., Hall, M., Khan, N., Jeyaneethi, J., Randeva, H., Kyrou, I. and Karteris, E. et al. (2022) ''. Journal of Clinical Medicine, 11 (19). pp. 1 - 18. ISSN: 2077-0383
Ragusa, D., Cicirò, Y., Federico, C., Saccone, S., Bruno, F., Saeedi, R., Sisu, C., Pina, C., Sala, A. and Tosi, S. et al. (2022) ''. Oncogenesis, 11 (1). pp. 1 - 7. ISSN: 2157-9024
Zahra, A., Kerslake, R., Kyrou, I., Randeva, H., Sisu, C. and Karteris, E. (2022) ''. International Journal of Molecular Sciences, 23 (10). pp. 1 - 14. ISSN: 1661-6596
Sisu, C. (2021) 'Pseudogenes as Biomarkers and Therapeutic Targets in Human Cancers', in Poliseno, L. (ed.) Methods in Molecular Biology. New York, NY, USA : Humana (Springer Nature). , 2324. pp. 319 - 337. ISBN 10: 1-0716-1503-3. ISBN 13: 978-1-0716-1502-7.
Sisu, C. (2021) 'GENCODE Pseudogenes', in Poliseno, L. (ed.) Methods in Molecular Biology. New York, NY, USA : Humana (Springer Nature). , 2324. pp. 67 - 82. ISBN 10: 1-0716-1503-3. ISBN 13: 978-1-0716-1502-7.
Zahra, A., Dong, Q., Hall, M., Jeyaneethi, J., Silva, E., Karteris, E. and Sisu, C. et al. (2021) ''. Journal of Clinical Medicine, 10 (9). pp. 1 - 20. ISSN: 2077-0383
Frankish, A., Diekhans, M., Jungreis, I., Lagarde, J., Loveland, JE., Mudge, JM., Sisu, C., Wright, JC., Armstrong, J., Barnes, I., Berry, A., Bignell, A., Boix, C., Carbonell Sala, S., Cunningham, F., Di Domenico, T., Donaldson, S., Fiddes, IT., GarcÃa Girón, C., Gonzalez, JM., Grego, T., Hardy, M., Hourlier, T., Howe, KL., Hunt, T., Izuogu, OG., Johnson, R., Martin, FJ., MartÃnez, L., Mohanan, S., Muir, P., Navarro, FCP., Parker, A., Pei, B., Pozo, F., Riera, FC., Ruffier, M., Schmitt, BM., Stapleton, E., Suner, MM., Sycheva, I., Uszczynska-Ratajczak, B., Wolf, MY., Xu, J., Yang, YT., Yates, A., Zerbino, D., Zhang, Y., Choudhary, JS., Gerstein, M., Guigó, R., Hubbard, TJP., Kellis, M., Paten, B., Tress, ML. and Flicek, P. et al. (2020) ''. Nucleic acids research, 49 (D1). pp. D916 - D923. ISSN: 1362-4962
Katopodis, P., Dong, Q., Halai, H., Fratila, CI., Polychronis, A., Anikin, V., Sisu, C. and Karteris, E. et al. (2020) ''. Cancers, 12 (12). pp. 1 - 16. ISSN: 2072-6694
Sisu, C., Muir, P., Frankish, A., Fiddes, I., Diekhans, M., Thybert, D., Odom, DT., Flicek, P., Keane, T., Hubbard, T., Harrow, J. and Gerstein, M. et al. (2020) ''. Nature Communications, 11 (1). pp. 1 - 14. ISSN: 2041-1723
The ENCODE Project Consortium., Moore, JE., Weng, Z. and Sisu, C. (2020) ''. Nature, 583 (7818). pp. 699 - 710. ISSN: 0028-0836
The ENCODE Project Consortium., Snyder, MP., Gingeras, TR., Abascal, F., Acosta, R., Addleman, NJ., Adrian, J., Afzal, V., Aken, B., Akiyama, JA., Jammal, OA., Amrhein, H., Anderson, SM., Andrews, GR., Antoshechkin, I., Ardlie, KG., Armstrong, J., Astley, M., Banerjee, B., Barkal, AA., Barnes, IHA., Barozzi, I., Barrell, D., Barson, G., Boley, N., Bates, D., Baymuradov, UK., Bazile, C., Beer, MA., Beik, S., Bender, MA., Bennett, R., Bouvrette, LPB., Bernstein, BE., Berry, A., Bhaskar, A., Bignell, A., Blue, SM., Bodine, DM., Boix, C., Borrman, T., Borsari, B., Boyle, AP., Brandsmeier, LA., Breschi, A., Bresnick, EH., Brooks, JA., Buckley, M., Burge, CB., Byron, R., Cahill, E., Cai, L., Cao, L., Carty, M., Castanon, RG., Castillo, A., Chaib, H., Chan, ET., Chee, DR., Chee, S., Chen, H., Chen, H., Chen, JY., Chen, S., Cherry, JM., Chhetri, SB., Choudhary, JS., Chrast, J., Chung, D., Clarke, D., Cody, NAL., Coppola, CJ., Coursen, J., D’Ippolito, AM., Dalton, S., Danyko, C., Davidson, C., Davila-Velderrain, J., Davis, CA., Dekker, J., Deran, A., DeSalvo, G., Despacio-Reyes, G., Dewey, CN., Dickel, DE., Diegel, M., Diekhans, M., Dileep, V., Ding, B., Djebali, S., Dobin, A., Dominguez, D., Donaldson, S., Drenkow, J., Dreszer, TR., Drier, Y., Duff, MO., Dunn, D., Eastman, C., Ecker, JR., Edwards, MD., El-Ali, N., Elhajjajy, SI. and Sisu, C. et al. (2020) ''. Nature, 583 (7818). pp. 693 - 698. ISSN: 0028-0836
Chudasama, D., Katopodis, P., Stone, N., Haskell, J., Sheridan, H., Gardner, B., Urnovitz, H., Schuetz, E., Beck, J., Hall, M., James, J., Sisu, C., Rice, A., Polychronis, A., Anikin, V. and Karteris, E. et al. (2019) ''. Cancers, 11 (3). pp. 331 - 331. ISSN: 2072-6694
Rogers‑Broadway, K-R., Kumar, J., Sisu, C., Wander, G., Mazey, E., Jeyaneethi, J., Pados, G., Tsolakidis, D., Klonos, E., Grunt, T., Hall, M., Chatterjee, J. and Karteris, E. et al. (2018) ''. International Journal of Molecular Medicine, 43 (1). pp. 47 - 56. ISSN: 1107-3756
Frankish, A., Diekhans, M., Ferreira, AM., Johnson, R., Jungreis, I., Loveland, J., Mudge, JM., Sisu, C., Wright, C., Armstrong, J., Barnes, I., Berry, A., Bignell, A., Carbonell Sala, S., Chrast, J., Cunningham, F., Di Domenico, T., Donaldson, S., Fiddes, IT., GarcÃa Girón, C., Gonzalez, JM., Grego, T., Hardy, M., Hourlier, T., Hunt, T., Izuogu, OG., Lagarde, J., Martin, FJ., MartÃnez, L., Mohanan, S., Muir, P., Navarro, FCP., Parker, A., Pei, B., Pozo, F., Ruffier, M., Schmitt, BM., Stapleton, E., Suner, MM., Sycheva, I., Uszczynska-Ratajczak, B., Xu, J., Yates, A., Zebrino, D., Zhang, Y., Aken, B., Choudhary, JS., Gerstein, MB., Guigó, R., Hubbard, TJP., Kellis, M., Paten, B., Reymond, A., Tress, ML. and Flicek, P. et al. (2018) ''. Nucleic Acids Research, 47 (D1). pp. D766 - D773. ISSN: 0305-1048
Lilue, J., Doran, AG., Fiddes, IT., Abrudan, M., Armstrong, J., Bennett, R., Chow, W., Collins, J., Collins, S., Czechanski, A., Danecek, P., Diekhans, M., Dolle, D-D., Dunn, M., Durbin, R., Earl, D., Ferguson-Smith, A., Flicek, P., Flint, J., Frankish, A., Fu, B., Gerstein, M., Gilbert, J., Goodstadt, L., Harrow, J., Howe, K., Ibarra-Soria, X., Kolmogorov, M., Lelliott, C., Logan, DW., Loveland, J., Mathews, CE., Mott, R., Muir, P., Nachtweide, S., Navarro, FCP., Odom, DT., Park, N., Pelan, S., Pham, SK., Quail, M., Reinholdt, L., Romoth, L., Shirley, L., Sisu, C., Sjoberg-Herrera, M., Stanke, M., Steward, C., Thomas, M., Threadgold, G., Thybert, D., Torrance, J., Wong, K., Wood, J., Yalcin, B., Yang, F., Adams, DJ., Paten, B. and Keane, TM. et al. (2018) ''. Nature Genetics, 50 (11). pp. 1574 - 1583. ISSN: 1061-4036
Thybert, D., Roller, M., Navarro, FCP., Fiddes, I., Streeter, I., Feig, C., Martin-Galvez, D., Kolmogorov, M., Janoušek, V., Akanni, W., Aken, B., Aldridge, S., Chakrapani, V., Chow, W., Clarke, L., Cummins, C., Doran, A., Dunn, M., Goodstadt, L., Howe, K., Howell, M., Josselin, AA., Karn, RC., Laukaitis, CM., Jingtao, L., Martin, F., Muffato, M., Nachtweide, S., Quail, MA., Sisu, C., Stanke, M., Stefflova, K., Van Oosterhout, C., Veyrunes, F., Ward, B., Yang, F., Yazdanifar, G., Zadissa, A., Adams, DJ., Brazma, A., Gerstein, M., Paten, B., Pham, S., Keane, TM., Odom, DT. and Flicek, P. et al. (2018) ''. Genome Research, 28 (4). pp. 448 - 459. ISSN: 1088-9051
Altshuler, DM., Durbin, RM., Abecasis, GR., Bentley, DR., Chakravarti, A., Clark, AG., Donnelly, P., Eichler, EE., Flicek, P., Gabriel, SB., Gibbs, RA., Green, ED., Hurles, ME., Knoppers, BM., Korbel, JO., Lander, ES., Lee, C., Lehrach, H., Mardis, ER., Marth, GT., McVean, GA., Nickerson, DA., Schmidt, JP., Sherry, ST., Wang, J., Wilson, RK., Gibbs, RA., Boerwinkle, E., Doddapaneni, H., Han, Y., Korchina, V., Kovar, C., Lee, S., Muzny, D., Reid, JG., Zhu, Y., Wang, J., Chang, Y., Feng, Q., Fang, X., Guo, X., Jian, M., Jiang, H., Jin, X., Lan, T., Li, G., Li, J., Li, Y., Liu, S., Liu, X., Lu, Y., Ma, X., Tang, M., Wang, B., Wang, G., Wu, H., Wu, R., Xu, X., Yin, Y., Zhang, D., Zhang, W., Zhao, J., Zhao, M., Zheng, X., Lander, ES., Altshuler, DM., Gabriel, SB., Gupta, N., Gharani, N., Toji, LH., Gerry, NP., Resch, AM., Flicek, P., Barker, J., Clarke, L., Gil, L., Hunt, SE., Kelman, G., Kulesha, E., Leinonen, R., McLaren, WM., Radhakrishnan, R., Roa, A., Smirnov, D., Smith, RE., Streeter, I., Thormann, A., Toneva, I., Vaughan, B., Zheng-Bradley, X., Bentley, DR., Grocock, R., Humphray, S., James, T., Kingsbury, Z., Lehrach, H., Sudbrak, R., Albrecht, MW., Amstislavskiy, VS., Borodina, TA., Lienhard, M., Mertes, F., Sultan, M., Timmermann, B., Yaspo, M-L., Mardis, ER., Wilson, RK., Fulton, L., Fulton, R., Sherry, ST., Ananiev, V., Belaia, Z., Beloslyudtsev, D., Bouk, N., Chen, C., Church, D., Cohen, R., Cook, C., Garner, J., Hefferon, T., Kimelman, M., Liu, C., Lopez, J., Meric, P., O'Sullivan, C., Ostapchuk, Y., Phan, L., Ponomarov, S., Schneider, V., Shekhtman, E., Sirotkin, K., Slotta, D., Zhang, H., McVean, GA., Durbin, RM., Balasubramaniam, S., Burton, J., Danecek, P., Keane, TM., Kolb-Kokocinski, A., McCarthy, S., Stalker, J., Quail, M., Schmidt, JP., Davies, CJ., Gollub, J., Webster, T., Wong, B., Zhan, Y., Auton, A., Campbell, CL., Kong, Y., Marcketta, A., Gibbs, RA., Yu, F., Antunes, L., Bainbridge, M., Muzny, D., Sabo, A., Huang, Z., Wang, J., Coin, LJM., Fang, L., Guo, X., Jin, X., Li, G., Li, Q., Li, Y., Li, Z., Lin, H., Liu, B., Luo, R., Shao, H., Xie, Y., Ye, C., Yu, C., Zhang, F., Zheng, H., Zhu, H., Alkan, C., Dal, E., Kahveci, F., Marth, GT., Garrison, EP., Kural, D., Lee, W-P., Leong, WF., Stromberg, M., Ward, AN., Wu, J., Zhang, M., Daly, MJ., DePristo, MA., Handsaker, RE., Altshuler, DM., Banks, E., Bhatia, G., del Angel, G., Gabriel, SB., Genovese, G., Gupta, N., Li, H., Kashin, S., Lander, ES., McCarroll, SA., Nemesh, JC., Poplin, RE., Yoon, SC., Lihm, J., Makarov, V., Clark, AG., Gottipati, S., Keinan, A., Rodriguez-Flores, JL., Korbel, JO., Rausch, T., Fritz, MH., Stuetz, AM., Flicek, P., Beal, K., Clarke, L., Datta, A., Herrero, J., McLaren, WM., Ritchie, GRS., Smith, RE., Zerbino, D., Zheng-Bradley, X., Sabeti, PC., Shlyakhter, I., Schaffner, SF., Vitti, J., Cooper, DN., Ball, EV., Stenson, PD., Bentley, DR., Barnes, B., Bauer, M., Cheetham, RK., Cox, A., Eberle, M., Humphray, S., Kahn, S., Murray, L., Peden, J., Shaw, R., Kenny, EE., Batzer, MA., Konkel, MK., Walker, JA., MacArthur, DG., Lek, M., Sudbrak, R., Amstislavskiy, VS., Herwig, R., Mardis, ER., Ding, L., Koboldt, DC., Larson, D., Ye, K., Gravel, S., Swaroop, A., Chew, E., Lappalainen, T., Erlich, Y., Gymrek, M., Willems, TF., Simpson, JT., Shriver, MD., Rosenfeld, JA., Bustamante, CD., Montgomery, SB., De La Vega, FM., Byrnes, JK., Carroll, AW., DeGorter, MK., Lacroute, P., Maples, BK., Martin, AR., Moreno-Estrada, A., Shringarpure, SS., Zakharia, F., Halperin, E., Baran, Y., Lee, C., Cerveira, E., Hwang, J., Malhotra, A., Plewczynski, D., Radew, K., Romanovitch, M., Zhang, C., Hyland, FCL., Craig, DW., Christoforides, A., Homer, N., Izatt, T., Kurdoglu, AA., Sinari, SA., Squire, K., Sherry, ST., Xiao, C., Sebat, J., Antaki, D., Gujral, M., Noor, A., Ye, K., Burchard, EG., Hernandez, RD., Gignoux, CR., Haussler, D., Katzman, SJ., Kent, WJ., Howie, B., Ruiz-Linares, A., Dermitzakis, ET., Devine, SE., Goncalo, RA., Kang, HM., Kidd, JM., Blackwell, T., Caron, S., Chen, W., Emery, S., Fritsche, L., Fuchsberger, C., Jun, G., Li, B., Lyons, R., Scheller, C., Sidore, C., Song, S., Sliwerska, E., Taliun, D., Tan, A., Welch, R., Wing, MK., Zhan, X., Awadalla, P., Hodgkinson, A., Li, Y., Shi, X., Quitadamo, A., Lunter, G., McVean, GA., Marchini, JL., Myers, S., Churchhouse, C., Delaneau, O., Gupta-Hinch, A., Kretzschmar, W., Iqbal, Z., Mathieson, I., Menelaou, A., Rimmer, A., Xifara, DK., Oleksyk, TK., Fu, Y., Liu, X., Xiong, M., Jorde, L., Witherspoon, D., Xing, J., Eichler, EE., Browning, BL., Browning, SR., Hormozdiari, F., Sudmant, PH., Khurana, E., Durbin, RM., Hurles, ME., Tyler-Smith, C., Albers, CA., Ayub, Q., Balasubramaniam, S., Chen, Y., Colonna, V., Danecek, P., Jostins, L., Keane, TM., McCarthy, S., Walter, K., Xue, Y., Gerstein, MB., Abyzov, A., Balasubramanian, S., Chen, J., Clarke, D., Fu, Y., Harmanci, AO., Jin, M., Lee, D., Liu, J., Mu, XJ., Zhang, J., Zhang, Y., Li, Y., Luo, R., Zhu, H., Alkan, C., Dal, E., Kahveci, F., Marth, GT., Garrison, EP., Kural, D., Lee, W-P., Ward, AN., Wu, J., Zhang, M., McCarroll, SA., Handsaker, RE., Altshuler, DM., Banks, E., Del Angel, G., Genovese, G., Hartl, C., Li, H., Kashin, S., Nemesh, JC., Shakir, K., Yoon, SC., Lihm, J., Makarov, V., Degenhardt, J., Korbel, JO., Fritz, MH., Meiers, S., Raeder, B., Rausch, T., Stuetz, AM., Flicek, P., Casale, FP., Clarke, L., Smith, RE., Stegle, O., Zheng-Bradley, X., Bentley, DR., Barnes, B., Cheetham, RK., Eberle, M., Humphray, S., Kahn, S., Murray, L., Shaw, R., Lameijer, E-W., Batzer, MA., Konkel, MK., Walker, JA., Ding, L., Hall, I., Ye, K., Lacroute, P., Lee, C., Cerveira, E., Malhotra, A., Hwang, J., Plewczynski, D., Radew, K., Romanovitch, M., Zhang, C., Craig, DW., Homer, N., Church, D., Xiao, C., Sebat, J., Antaki, D., Bafna, V., Michaelson, J., Ye, K., Devine, SE., Gardner, EJ., Abecasis, GR., Kidd, JM., Mills, RE., Dayama, G., Emery, S., Jun, G., Shi, X., Quitadamo, A., Lunter, G., McVean, GA., Chen, K., Fan, X., Chong, Z., Chen, T., Witherspoon, D., Xing, J., Eichler, EE., Chaisson, MJ., Hormozdiari, F., Huddleston, J., Malig, M., Nelson, BJ., Sudmant, PH., Parrish, NF., Khurana, E., Hurles, ME., Blackburne, B., Lindsay, SJ., Ning, Z., Walter, K., Zhang, Y., Gerstein, MB., Abyzov, A., Chen, J., Clarke, D., Lam, H., Mu, XJ., Sisu, C., Zhang, J., Zhang, Y., Gibbs, RA., Yu, F., Bainbridge, M., Challis, D., Evani, US., Kovar, C., Lu, J., Muzny, D., Nagaswamy, U., Reid, JG., Sabo, A., Yu, J., Guo, X., Li, W., Li, Y., Wu, R., Marth, GT., Garrison, EP., Leong, WF., Ward, AN., del Angel, G., DePristo, MA., Gabriel, SB., Gupta, N., Hartl, C., Poplin, RE., Clark, AG., Rodriguez-Flores, JL., Flicek, P., Clarke, L., Smith, RE., Zheng-Bradley, X., MacArthur, DG., Mardis, ER., Fulton, R., Koboldt, DC., Gravel, S., Bustamante, CD., Craig, DW., Christoforides, A., Homer, N., Izatt, T., Sherry, ST., Xiao, C., Dermitzakis, ET., Abecasis, GR., Kang, HM., McVean, GA., Gerstein, MB., Balasubramanian, S., Habegger, L., Yu, H., Flicek, P., Clarke, L., Cunningham, F., Dunham, I., Zerbino, D., Zheng-Bradley, X., Lage, K., Jespersen, JB., Horn, H., Montgomery, SB., DeGorter, MK., Khurana, E., Tyler-Smith, C., Chen, Y., Colonna, V., Xue, Y., Gerstein, MB., Balasubramanian, S., Fu, Y., Kim, D., Auton, A., Marcketta, A., Desalle, R., Narechania, A., Sayres, MAW., Garrison, EP., Handsaker, RE., Kashin, S., McCarroll, SA., Rodriguez-Flores, JL., Flicek, P., Clarke, L., Zheng-Bradley, X., Erlich, Y., Gymrek, M., Willems, TF., Bustamante, CD., Mendez, FL., Poznik, GD., Underhill, PA., Lee, C., Cerveira, E., Malhotra, A., Romanovitch, M., Zhang, C., Abecasis, GR., Coin, L., Shao, H., Mittelman, D., Tyler-Smith, C., Ayub, Q., Banerjee, R., Cerezo, M., Chen, Y., Fitzgerald, T., Louzada, S., Massaia, A., McCarthy, S., Ritchie, GR., Xue, Y., Yang, F., Gibbs, RA., Kovar, C., Kalra, D., Hale, W., Muzny, D., Reid, JG., Wang, J., Dan, X., Guo, X., Li, G., Li, Y., Ye, C., Zheng, X., Altshuler, DM., Flicek, P., Clarke, L., Zheng-Bradley, X., Bentley, DR., Cox, A., Humphray, S., Kahn, S., Sudbrak, R., Albrecht, MW., Lienhard, M., Larson, D., Craig, DW., Izatt, T., Kurdoglu, AA., Sherry, ST., Xiao, C., Haussler, D., Abecasis, GR., McVean, GA., Durbin, RM., Balasubramaniam, S., Keane, TM., McCarthy, S., Stalker, J., Chakravarti, A., Knoppers, BM., Abecasis, GR., Barnes, KC., Beiswanger, C., Burchard, EG., Bustamante, CD., Cai, H., Cao, H., Durbin, RM., Gerry, NP., Gharani, N., Gibbs, RA., Gignoux, CR., Gravel, S., Henn, B., Jones, D., Jorde, L., Kaye, JS., Keinan, A., Kent, A., Kerasidou, A., Li, Y., Mathias, R., McVean, GA., Moreno-Estrada, A., Ossorio, PN., Parker, M., Resch, AM., Rotimi, CN., Royal, CD., Sandoval, K., Su, Y., Sudbrak, R., Tian, Z., Tishkoff, S., Toji, LH., Tyler-Smith, C., Via, M., Wang, Y., Yang, H., Yang, L., Zhu, J., Bodmer, W., Bedoya, G., Ruiz-Linares, A., Cai, Z., Gao, Y., Chu, J., Peltonen, L., Garcia-Montero, A., Orfao, A., Dutil, J., Martinez-Cruzado, JC., Oleksyk, TK., Barnes, KC., Mathias, RA., Hennis, A., Watson, H., McKenzie, C., Qadri, F., LaRocque, R., Sabeti, PC., Zhu, J., Deng, X., Sabeti, PC., Asogun, D., Folarin, O., Happi, C., Omoniwa, O., Stremlau, M., Tariyal, R., Jallow, M., Joof, FS., Corrah, T., Rockett, K., Kwiatkowski, D., Kooner, J., Tran, TH., Dunstan, SJ., Nguyen, TH., Fonnie, R., Garry, R., Kanneh, L., Moses, L., Sabeti, PC., Schieffelin, J., Grant, DS., Gallo, C., Poletti, G., Saleheen, D., Rasheed, A., Brook, LD., Felsenfeld, A., McEwen, JE., Vaydylevich, Y., Green, ED., Duncanson, A., Dunn, M., Schloss, JA., Wang, J., Yang, H., Auton, A., Brooks, LD., Durbin, RM., Garrison, EP., Kang, HM., Korbel, JO., Marchini, JL., McCarthy, S., McVean, GA. and Abecasis, GR. et al. (2015) ''. NATURE, 526 (7571). pp. 68. ISSN: 0028-0836
Wang, D., Yan, KK., Sisu, C., Cheng, C., Rozowsky, J., Meyerson, W. and Gerstein, MB. et al. (2015) ''. PLoS Computational Biology, 11 (4). pp. e1004132 - e1004132. ISSN: 1553-734X
Sisu, C., Pei, B., Leng, J., Frankish, A., Zhang, Y., Balasubramanian, S., Harte, R., Wang, D., Rutenberg-Schoenberg, M., Clark, W., Diekhans, M., Rozowsky, J., Hubbard, T., Harrow, J. and Gerstein, MB. et al. (2014) ''. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 111 (37). pp. 13361 - 13366. ISSN: 0027-8424
Gerstein, MB., Rozowsky, J., Yan, KK., Wang, D., Cheng, C., Brown, JB., Davis, CA., Hillier, L., Sisu, C., Li, JJ., Pei, B., Harmanci, AO., Duff, MO., Djebali, S., Alexander, RP., Alver, BH., Auerbach, R., Bell, K., Bickel, PJ., Boeck, ME., Boley, NP., Booth, BW., Cherbas, L., Cherbas, P., Di, C., Dobin, A., Drenkow, J., Ewing, B., Fang, G., Fastuca, M., Feingold, EA., Frankish, A., Gao, G., Good, PJ., Guigó, R., Hammonds, A., Harrow, J., Hoskins, RA., Howald, C., Hu, L., Huang, H., Hubbard, TJP., Huynh, C., Jha, S., Kasper, D., Kato, M., Kaufman, TC., Kitchen, RR., Ladewig, E., Lagarde, J., Lai, E., Leng, J., Lu, Z., MacCoss, M., May, G., McWhirter, R., Merrihew, G., Miller, DM., Mortazavi, A., Murad, R., Oliver, B., Olson, S., Park, PJ., Pazin, MJ., Perrimon, N., Pervouchine, D., Reinke, V., Reymond, A., Robinson, G., Samsonova, A., Saunders, GI., Schlesinger, F., Sethi, A., Slack, FJ., Spencer, WC., Stoiber, MH., Strasbourger, P., Tanzer, A., Thompson, OA., Wan, KH., Wang, G., Wang, H., Watkins, KL., Wen, J., Wen, K., Xue, C., Yang, L., Yip, K., Zaleski, C., Zhang, Y., Zheng, H., Brenner, SE., Graveley, BR., Celniker, SE., Gingeras, TR. and Waterston, R. et al. (2014) ''. Nature, 512 (7515). pp. 445 - 448. ISSN: 0028-0836
Delaneau, O., Marchini, J., McVeanh, GA., Donnelly, P., Lunter, G., Marchini, JL., Myers, S., Gupta-Hinch, A., Iqbal, Z., Mathieson, I., Rimmer, A., Xifara, DK., Kerasidou, A., Churchhouse, C., Altshuler, DM., Gabriel, SB., Lander, ES., Gupta, N., Daly, MJ., DePristo, MA., Banks, E., Bhatia, G., Carneiro, MO., Del Angel, G., Genovese, G., Handsaker, RE., Hartl, C., McCarroll, SA., Nemesh, JC., Poplin, RE., Schaffner, SF., Shakir, K., Sabeti, PC., Grossman, SR., Tabrizi, S., Tariyal, R., Li, H., Reich, D., Durbin, RM., Hurles, ME., Balasubramaniam, S., Burton, J., Danecek, P., Keane, TM., Kolb-Kokocinski, A., McCarthy, S., Stalker, J., Quail, M., Ayub, Q., Chen, Y., Coffey, AJ., Colonna, V., Huang, N., Jostins, L., Scally, A., Walter, K., Xue, Y., Zhang, Y., Blackburne, B., Lindsay, SJ., Ning, Z., Frankish, A., Harrow, J., Chris, TS., Abecasis, GR., Kang, HM., Anderson, P., Blackwell, T., Busonero, F., Fuchsberger, C., Jun, G., Maschio, A., Porcu, E., Sidore, C., Tan, A., Trost, MK., Bentley, DR. and Grocock, R. et al. (2014) ''. Nature Communications, 5 (1). pp. 3934. ISSN: 2041-1723
Khurana, E., Fu, Y., Colonna, V., Mu, XJ., Kang, HM., Lappalainen, T., Sboner, A., Lochovsky, L., Chen, J., Harmanci, A., Das, J., Abyzov, A., Balasubramanian, S., Beal, K., Chakravarty, D., Challis, D., Chen, Y., Clarke, D., Clarke, L., Cunningham, F., Evani, US., Flicek, P., Fragoza, R., Garrison, E., Gibbs, R., Guemues, ZH., Herrero, J., Kitabayashi, N., Kong, Y., Lage, K., Liluashvili, V., Lipkin, SM., MacArthur, DG., Marth, G., Muzny, D., Pers, TH., Ritchie, GRS., Rosenfeld, JA., Sisu, C., Wei, X., Wilson, M., Xue, Y., Yu, F., Dermitzakis, ET., Yu, H., Rubin, MA., Tyler-Smith, C. and Gerstein, M. et al. (2013) ''. SCIENCE, 342 (6154). pp. 84. ISSN: 0036-8075
Altshuler, DM., Durbin, RM., Abecasis, GR., Bentley, DR., Chakravarti, A., Clark, AG., Donnelly, P., Eichler, EE., Flicek, P., Gabriel, SB., Gibbs, RA., Green, ED., Hurles, ME., Knoppers, BM., Korbel, JO., Lander, ES., Lee, C., Lehrach, H., Mardis, ER., Marth, GT., McVean, GA., Nickerson, DA., Schmidt, JP., Sherry, ST., Wang, J., Wilson, RK., Gibbs, RA., Dinh, H., Kovar, C., Lee, S., Lewis, L., Muzny, D., Reid, J., Wang, M., Wang, J., Fang, X., Guo, X., Jian, M., Jiang, H., Jin, X., Li, G., Li, J., Li, Y., Li, Z., Liu, X., Lu, Y., Ma, X., Su, Z., Tai, S., Tang, M., Wang, B., Wang, G., Wu, H., Wu, R., Yin, Y., Zhang, W., Zhao, J., Zhao, M., Zheng, X., Zhou, Y., Lander, ES., Altshuler, DM., Gabriel, SB., Gupta, N., Flicek, P., Clarke, L., Leinonen, R., Smith, RE., Zheng-Bradley, X., Bentley, DR., Grocock, R., Humphray, S., James, T., Kingsbury, Z., Lehrach, H., Sudbrak, R., Albrecht, MW., Amstislavskiy, VS., Borodina, TA., Lienhard, M., Mertes, F., Sultan, M., Timmermann, B., Yaspo, M-L., Sherry, ST., McVean, GA., Mardis, ER., Wilson, RK., Fulton, L., Fulton, R., Weinstock, GM., Durbin, RM., Balasubramaniam, S., Burton, J., Danecek, P., Keane, TM., Kolb-Kokocinski, A., McCarthy, S., Stalker, J., Quail, M., Schmidt, JP., Davies, CJ., Gollub, J., Webster, T., Wong, B., Zhan, Y., Auton, A., Gibbs, RA., Yu, F., Bainbridge, M., Challis, D., Evani, US., Lu, J., Muzny, D., Nagaswamy, U., Reid, J., Sabo, A., Wang, Y., Yu, J., Wang, J., Coin, LJM., Fang, L., Guo, X., Jin, X., Li, G., Li, Q., Li, Y., Li, Z., Lin, H., Liu, B., Luo, R., Qin, N., Shao, H., Wang, B., Xie, Y., Ye, C., Yu, C., Zhang, F., Zheng, H., Zhu, H., Marth, GT., Garrison, EP., Kural, D., Lee, W-P., Leong, WF., Ward, AN., Wu, J., Zhang, M., Lee, C., Griffin, L., Hsieh, C-H., Mills, RE., Shi, X., von Grotthuss, M., Zhang, C., Daly, MJ., DePristo, MA., Altshuler, DM., Banks, E., Bhatia, G., Carneiro, MO., del Angel, G., Gabriel, SB., Genovese, G., Gupta, N., Handsaker, RE., Hartl, C., Lander, ES., McCarroll, SA., Nemesh, JC., Poplin, RE., Schaffner, SF., Shakir, K., Yoon, SC., Lihm, J., Makarov, V., Jin, H., Kim, W., Kim, KC., Korbel, JO., Rausch, T., Flicek, P., Beal, K., Clarke, L., Cunningham, F., Herrero, J., McLaren, WM., Ritchie, GRS., Smith, RE., Zheng-Bradley, X., Clark, AG., Gottipati, S., Keinan, A., Rodriguez-Flores, JL., Sabeti, PC., Grossman, SR., Tabrizi, S., Tariyal, R., Cooper, DN., Ball, EV., Stenson, PD., Bentley, DR., Barnes, B., Bauer, M., Cheetham, RK., Cox, T., Eberle, M., Humphray, S., Kahn, S., Murray, L., Peden, J., Shaw, R., Ye, K., Batzer, MA., Konkel, MK., Walker, JA., MacArthur, DG., Lek, M., Sudbrak, R., Amstislavskiy, VS., Herwig, R., Shriver, MD., Bustamante, CD., Byrnes, JK., De la Vega, FM., Gravel, S., Kenny, EE., Kidd, JM., Lacroute, P., Maples, BK., Moreno-Estrada, A., Zakharia, F., Halperin, E., Baran, Y., Craig, DW., Christoforides, A., Homer, N., Izatt, T., Kurdoglu, AA., Sinari, SA., Squire, K., Sherry, ST., Xiao, C., Sebat, J., Bafna, V., Ye, K., Burchard, EG., Hernandez, RD., Gignoux, CR., Haussler, D., Katzman, SJ., Kent, WJ., Howie, B., Ruiz-Linares, A., Dermitzakis, ET., Lappalainen, T., Devine, SE., Liu, X., Maroo, A., Tallon, LJ., Rosenfeld, JA., Michelson, LP., Abecasis, GR., Kang, HM., Anderson, P., Angius, A., Bigham, A., Blackwell, T., Busonero, F., Cucca, F., Fuchsberger, C., Jones, C., Jun, G., Li, Y., Lyons, R., Maschio, A., Porcu, E., Reinier, F., Sanna, S., Schlessinger, D., Sidore, C., Tan, A., Trost, MK., Awadalla, P., Hodgkinson, A., Lunter, G., McVean, GA., Marchini, JL., Myers, S., Churchhouse, C., Delaneau, O., Gupta-Hinch, A., Iqbal, Z., Mathieson, I., Rimmer, A., Xifara, DK., Oleksyk, TK., Fu, Y., Liu, X., Xiong, M., Jorde, L., Witherspoon, D., Xing, J., Eichler, EE., Browning, BL., Alkan, C., Hajirasouliha, I., Hormozdiari, F., Ko, A., Sudmant, PH., Mardis, ER., Chen, K., Chinwalla, A., Ding, L., Dooling, D., Koboldt, DC., McLellan, MD., Wallis, JW., Wendl, MC., Zhang, Q., Durbin, RM., Hurles, ME., Tyler-Smith, C., Albers, CA., Ayub, Q., Balasubramaniam, S., Chen, Y., Coffey, AJ., Colonna, V., Danecek, P., Huang, N., Jostins, L., Keane, TM., Li, H., McCarthy, S., Scally, A., Stalker, J., Walter, K., Xue, Y., Zhang, Y., Gerstein, MB., Abyzov, A., Balasubramanian, S., Chen, J., Clarke, D., Fu, Y., Habegger, L., Harmanci, AO., Jin, M., Khurana, E., Mu, XJ., Sisu, C., Li, Y., Luo, R., Zhu, H., Lee, C., Griffin, L., Hsieh, C-H., Mills, RE., Shi, X., von Grotthuss, M., Zhang, C., Marth, GT., Garrison, EP., Kural, D., Lee, W-P., Ward, AN., Wu, J., Zhang, M., McCarroll, SA., Altshuler, DM., Banks, E., del Angel, G., Genovese, G., Handsaker, RE., Hartl, C., Nemesh, JC., Shakir, K., Yoon, SC., Lihm, J., Makarov, V., Degenhardt, J., Flicek, P., Clarke, L., Smith, RE., Zheng-Bradley, X., Korbel, JO., Rausch, T., Stuetz, AM., Bentley, DR., Barnes, B., Cheetham, RK., Eberle, M., Humphray, S., Kahn, S., Murray, L., Shaw, R., Ye, K., Batzer, MA., Konkel, MK., Walker, JA., Lacroute, P., Craig, DW., Homer, N., Church, D., Xiao, C., Sebat, J., Bafna, V., Michaelson, JJ., Ye, K., Devine, SE., Liu, X., Maroo, A., Tallon, LJ., Lunter, G., McVean, GA., Iqbal, Z., Witherspoon, D., Xing, J., Eichler, EE., Alkan, C., Hajirasouliha, I., Hormozdiari, F., Ko, A., Sudmant, PH., Chen, K., Chinwalla, A., Ding, L., McLellan, MD., Wallis, JW., Hurles, ME., Ben, B., Li, H., Lindsay, SJ., Ning, Z., Scally, A., Walter, K., Zhang, Y., Gerstein, MB., Abyzov, A., Chen, J., Clarke, D., Khurana, E., Mu, XJ., Sisu, C., Gibbs, RA., Yu, F., Bainbridge, M., Challis, D., Evani, US., Kovar, C., Lewis, L., Lu, J., Muzny, D., Nagaswamy, U., Reid, J., Sabo, A., Yu, J., Guo, X., Li, Y., Wu, R., Marth, GT., Garrison, EP., Leong, WF., Ward, AN., del Angel, G., DePristo, MA., Gabriel, SB., Gupta, N., Hartl, C., Poplin, RE., Clark, AG., Rodriguez-Flores, JL., Flicek, P., Clarke, L., Smith, RE., Zheng-Bradley, X., MacArthur, DG., Bustamante, CD., Gravel, S., Craig, DW., Christoforides, A., Homer, N., Izatt, T., Sherry, ST., Xiao, C., Dermitzakis, ET., Abecasis, GR., Kang, HM., McVean, GA., Mardis, ER., Dooling, D., Fulton, L., Fulton, R., Koboldt, DC., Durbin, RM., Balasubramaniam, S., Keane, TM., McCarthy, S., Stalker, J., Gerstein, MB., Balasubramanian, S., Habegger, L., Garrison, EP., Gibbs, RA., Bainbridge, M., Muzny, D., Yu, F., Yu, J., del Angel, G., Handsaker, RE., Makarov, V., Rodriguez-Flores, JL., Jin, H., Kim, W., Kim, KC., Flicek, P., Beal, K., Clarke, L., Cunningham, F., Herrero, J., McLaren, WM., Ritchie, GRS., Zheng-Bradley, X., Tabrizi, S., MacArthur, DG., Lek, M., Bustamante, CD., De la Vega, FM., Craig, DW., Kurdoglu, AA., Lappalainen, T., Rosenfeld, JA., Michelson, LP., Awadalla, P., Hodgkinson, A., McVean, GA., Chen, K., Tyler-Smith, C., Chen, Y., Colonna, V., Frankish, A., Harrow, J., Xue, Y., Gerstein, MB., Abyzov, A., Balasubramanian, S., Chen, J., Clarke, D., Fu, Y., Harmanci, AO., Jin, M., Khurana, E., Mu, XJ., Sisu, C., Gibbs, RA., Fowler, G., Hale, W., Kalra, D., Kovar, C., Muzny, D., Reid, J., Wang, J., Guo, X., Li, G., Li, Y., Zheng, X., Altshuler, DM., Flicek, P., Clarke, L., Barker, J., Kelman, G., Kulesha, E., Leinonen, R., McLaren, WM., Radhakrishnan, R., Roa, A., Smirnov, D., Smith, RE., Streeter, I., Toneva, I., Vaughan, B., Zheng-Bradley, X., Bentley, DR., Cox, T., Humphray, S., Kahn, S., Sudbrak, R., Albrecht, MW., Lienhard, M., Craig, DW., Izatt, T., Kurdoglu, AA., Sherry, ST., Ananiev, V., Belaia, Z., Beloslyudtsev, D., Bouk, N., Chen, C., Church, D., Cohen, R., Cook, C., Garner, J., Hefferon, T., Kimelman, M., Liu, C., Lopez, J., Meric, P., O'Sullivan, C., Ostapchuk, Y., Phan, L., Ponomarov, S., Schneider, V., Shekhtman, E., Sirotkin, K., Slotta, D., Xiao, C., Zhang, H., Haussler, D., Abecasis, GR., McVean, GA., Alkan, C., Ko, A., Dooling, D., Durbin, RM., Balasubramaniam, S., Keane, TM., McCarthy, S., Stalker, J., Chakravarti, A., Knoppers, BM., Abecasis, GR., Barnes, KC., Beiswanger, C., Burchard, EG., Bustamante, CD., Cai, H., Cao, H., Durbin, RM., Gharani, N., Gibbs, RA., Gignoux, CR., Gravel, S., Henn, B., Jones, D., Jorde, L., Kaye, JS., Keinan, A., Kent, A., Kerasidou, A., Li, Y., Mathias, R., McVean, GA., Moreno-Estrada, A., Ossorio, PN., Parker, M., Reich, D., Rotimi, CN., Royal, CD., Sandoval, K., Su, Y., Sudbrak, R., Tian, Z., Timmermann, B., Tishkoff, S., Toji, LH., Tyler-Smith, C., Via, M., Wang, Y., Yang, H., Yang, L., Zhu, J., Bodmer, W., Bedoya, G., Ruiz-Linares, A., Ming, CZ., Yang, G., You, CJ., Peltonen, L., Garcia-Montero, A., Orfao, A., Dutil, J., Martinez-Cruzado, JC., Oleksyk, TK., Brooks, LD., Felsenfeld, AL., McEwen, JE., Clemm, NC., Duncanson, A., Dunn, M., Green, ED., Guyer, MS., Peterson, JL., Abecasis, GR., Auton, A., Brooks, LD., DePristo, MA., Durbin, RM., Handsaker, RE., Kang, HM., Marth, GT. and McVean, GA. et al. (2012) ''. NATURE, 491 (7422). pp. 56 - 65. ISSN: 0028-0836
Dunham, I., Kundaje, A., Aldred, SF., Collins, PJ., Davis, C., Doyle, F., Epstein, CB., Frietze, S., Harrow, J., Kaul, R., Khatun, J., Lajoie, BR., Landt, SG., Lee, B-K., Pauli, F., Rosenbloom, KR., Sabo, P., Safi, A., Sanyal, A., Shoresh, N., Simon, JM., Song, L., Trinklein, ND., Altshuler, RC., Birney, E., Brown, JB., Cheng, C., Djebali, S., Dong, X., Dunham, I., Ernst, J., Furey, TS., Gerstein, M., Giardine, B., Greven, M., Hardison, RC., Harris, RS., Herrero, J., Hoffman, MM., Iyer, S., Kellis, M., Khatun, J., Kheradpour, P., Kundaje, A., Lassmann, T., Li, Q., Lin, X., Marinov, GK., Merkel, A., Mortazavi, A., Parker, SCJ., Reddy, TE., Rozowsky, J., Schlesinger, F., Thurman, RE., Wang, J., Ward, LD., Whitfield, TW., Wilder, SP., Wu, W., Xi, HS., Yip, KY., Zhuang, J., Bernstein, BE., Birney, E., Dunham, I., Green, ED., Gunter, C., Snyder, M., Pazin, MJ., Lowdon, RF., Dillon, LAL., Adams, LB., Kelly, CJ., Zhang, J., Wexler, JR., Green, ED., Good, PJ., Feingold, EA., Bernstein, BE., Birney, E., Crawford, GE., Dekker, J., Elnitski, L., Farnham, PJ., Gerstein, M., Giddings, MC., Gingeras, TR., Green, ED., Guigo, R., Hardison, RC., Hubbard, TJ., Kellis, M., Kent, WJ., Lieb, JD., Margulies, EH., Myers, RM., Snyder, M., Stamatoyannopoulos, JA., Tenenbaum, SA., Weng, Z., White, KP., Wold, B., Khatun, J., Yu, Y., Wrobel, J., Risk, BA., Gunawardena, HP., Kuiper, HC., Maier, CW., Xie, L., Chen, X., Giddings, MC., Bernstein, BE., Epstein, CB., Shoresh, N., Ernst, J., Kheradpour, P., Mikkelsen, TS., Gillespie, S., Goren, A., Ram, O., Zhang, X., Wang, L., Issner, R., Coyne, MJ., Durham, T., Ku, M., Truong, T., Ward, LD., Altshuler, RC., Eaton, ML., Kellis, M., Djebali, S., Davis, CA., Merkel, A., Dobin, A., Lassmann, T., Mortazavi, A., Tanzer, A., Lagarde, J., Lin, W., Schlesinger, F., Xue, C., Marinov, GK., Khatun, J., Williams, BA., Zaleski, C., Rozowsky, J., Roeder, M., Kokocinski, F., Abdelhamid, RF., Alioto, T., Antoshechkin, I., Baer, MT., Batut, P., Bell, I., Bell, K., Chakrabortty, S., Chen, X., Chrast, J., Curado, J., Derrien, T., Drenkow, J., Dumais, E., Dumais, J., Duttagupta, R., Fastuca, M., Fejes-Toth, K., Ferreira, P., Foissac, S., Fullwood, MJ., Gao, H., Gonzalez, D., Gordon, A., Gunawardena, HP., Howald, C., Jha, S., Johnson, R., Kapranov, P., King, B., Kingswood, C., Li, G., Luo, OJ., Park, E., Preall, JB., Presaud, K., Ribeca, P., Risk, BA., Robyr, D., Ruan, X., Sammeth, M., Sandhu, KS., Schaeffer, L., See, L-H., Shahab, A., Skancke, J., Suzuki, AM., Takahashi, H., Tilgner, H., Trout, D., Walters, N., Wang, H., Wrobel, J., Yu, Y., Hayashizaki, Y., Harrow, J., Gerstein, M., Hubbard, TJ., Reymond, A., Antonarakis, SE., Hannon, GJ., Giddings, MC., Ruan, Y., Wold, B., Carninci, P., Guigo, R., Gingeras, TR., Rosenbloom, KR., Sloan, CA., Learned, K., Malladi, VS., Wong, MC., Barber, G., Cline, MS., Dreszer, TR., Heitner, SG., Karolchik, D., Kent, WJ., Kirkup, VM., Meyer, LR., Long, JC., Maddren, M., Raney, BJ., Furey, TS., Song, L., Grasfeder, LL., Giresi, PG., Lee, B-K., Battenhouse, A., Sheffield, NC., Simon, JM., Showers, KA., Safi, A., London, D., Bhinge, AA., Shestak, C., Schaner, MR., Kim, SK., Zhang, ZZ., Mieczkowski, PA., Mieczkowska, JO., Liu, Z., McDaniell, RM., Ni, Y., Rashid, NU., Kim, MJ., Adar, S., Zhang, Z., Wang, T., Winter, D., Keefe, D., Birney, E., Iyer, VR., Lieb, JD., Crawford, GE., Li, G., Sandhu, KS., Zheng, M., Wang, P., Luo, OJ., Shahab, A., Fullwood, MJ., Ruan, X., Ruan, Y., Myers, RM., Pauli, F., Williams, BA., Gertz, J., Marinov, GK., Reddy, TE., Vielmetter, J., Partridge, EC., Trout, D., Varley, KE., Gasper, C., Bansal, A., Pepke, S., Jain, P., Amrhein, H., Bowling, KM., Anaya, M., Cross, MK., King, B., Muratet, MA., Antoshechkin, I., Newberry, KM., Mccue, K., Nesmith, AS., Fisher-Aylor, KI., Pusey, B., DeSalvo, G., Parker, SL., Balasubramanian, S., Davis, NS., Meadows, SK., Eggleston, T., Gunter, C., Newberry, JS., Levy, SE., Absher, DM., Mortazavi, A., Wong, WH., Wold, B., Blow, MJ., Visel, A., Pennachio, LA., Elnitski, L., Margulies, EH., Parker, SCJ., Petrykowska, HM., Abyzov, A., Aken, B., Barrell, D., Barson, G., Berry, A., Bignell, A., Boychenko, V., Bussotti, G., Chrast, J., Davidson, C., Derrien, T., Despacio-Reyes, G., Diekhans, M., Ezkurdia, I., Frankish, A., Gilbert, J., Gonzalez, JM., Griffiths, E., Harte, R., Hendrix, DA., Howald, C., Hunt, T., Jungreis, I., Kay, M., Khurana, E., Kokocinski, F., Leng, J., Lin, MF., Loveland, J., Lu, Z., Manthravadi, D., Mariotti, M., Mudge, J., Mukherjee, G., Notredame, C., Pei, B., Rodriguez, JM., Saunders, G., Sboner, A., Searle, S., Sisu, C., Snow, C., Steward, C., Tanzer, A., Tapanari, E., Tress, ML., van Baren, MJ., Walters, N., Washietl, S., Wilming, L., Zadissa, A., Zhang, Z., Brent, M., Haussler, D., Kellis, M., Valencia, A., Gerstein, M., Reymond, A., Guigo, R., Harrow, J., Hubbard, TJ., Landt, SG., Frietze, S., Abyzov, A., Addleman, N., Alexander, RP., Auerbach, RK., Balasubramanian, S., Bettinger, K., Bhardwaj, N., Boyle, AP., Cao, AR., Cayting, P., Charos, A., Cheng, Y., Cheng, C., Eastman, C., Euskirchen, G., Fleming, JD., Grubert, F., Habegger, L., Hariharan, M., Harmanci, A., Iyengar, S., Jin, VX., Karczewski, KJ., Kasowski, M., Lacroute, P., Lam, H., Lamarre-Vincent, N., Leng, J., Lian, J., Lindahl-Allen, M., Min, R., Miotto, B., Monahan, H., Moqtaderi, Z., Mu, XJ., O'Geen, H., Ouyang, Z., Patacsil, D., Pei, B., Raha, D., Ramirez, L., Reed, B., Rozowsky, J., Sboner, A., Shi, M., Sisu, C., Slifer, T., Witt, H., Wu, L., Xu, X., Yan, K-K., Yang, X., Yip, KY., Zhang, Z., Struhl, K., Weissman, SM., Gerstein, M., Farnham, PJ., Snyder, M., Tenenbaum, SA., Penalva, LO., Doyle, F., Karmakar, S., Landt, SG., Bhanvadia, RR., Choudhury, A., Domanus, M., Ma, L., Moran, J., Patacsil, D., Slifer, T., Victorsen, A., Yang, X., Snyder, M., White, KP., Auer, T., Centanin, L., Eichenlaub, M., Gruhl, F., Heermann, S., Hoeckendorf, B., Inoue, D., Kellner, T., Kirchmaier, S., Mueller, C., Reinhardt, R., Schertel, L., Schneider, S., Sinn, R., Wittbrodt, B., Wittbrodt, J., Weng, Z., Whitfield, TW., Wang, J., Collins, PJ., Aldred, SF., Trinklein, ND., Partridge, EC., Myers, RM., Dekker, J., Jain, G., Lajoie, BR., Sanyal, A., Balasundaram, G., Bates, DL., Byron, R., Canfield, TK., Diegel, MJ., Dunn, D., Ebersol, AK., Frum, T., Garg, K., Gist, E., Hansen, RS., Boatman, L., Haugen, E., Humbert, R., Jain, G., Johnson, AK., Johnson, EM., Kutyavin, TV., Lajoie, BR., Lee, K., Lotakis, D., Maurano, MT., Neph, SJ., Neri, FV., Nguyen, ED., Qu, H., Reynolds, AP., Roach, V., Rynes, E., Sabo, P., Sanchez, ME., Sandstrom, RS., Sanyal, A., Shafer, AO., Stergachis, AB., Thomas, S., Thurman, RE., Vernot, B., Vierstra, J., Vong, S., Wang, H., Weaver, MA., Yan, Y., Zhang, M., Akey, JM., Bender, M., Dorschner, MO., Groudine, M., MacCoss, MJ., Navas, P., Stamatoyannopoulos, G., Kaul, R., Dekker, J., Stamatoyannopoulos, JA., Dunham, I., Beal, K., Brazma, A., Flicek, P., Herrero, J., Johnson, N., Keefe, D., Lukk, M., Luscombe, NM., Sobral, D., Vaquerizas, JM., Wilder, SP., Batzoglou, S., Sidow, A., Hussami, N., Kyriazopoulou-Panagiotopoulou, S., Libbrecht, MW., Schaub, MA., Kundaje, A., Hardison, RC., Miller, W., Giardine, B., Harris, RS., Wu, W., Bickel, PJ., Banfai, B., Boley, NP., Brown, JB., Huang, H., Li, Q., Li, JJ., Noble, WS., Bilmes, JA., Buske, OJ., Hoffman, MM., Sahu, AD., Kharchenko, PV., Park, PJ., Baker, D., Taylor, J., Weng, Z., Iyer, S., Dong, X., Greven, M., Lin, X., Wang, J., Xi, HS., Zhuang, J., Gerstein, M., Alexander, RP., Balasubramanian, S., Cheng, C., Harmanci, A., Lochovsky, L., Min, R., Mu, XJ., Rozowsky, J., Yan, K-K., Yip, KY. and Birney, E. et al. (2012) ''. NATURE, 489 (7414). pp. 57 - 74. ISSN: 0028-0836
Pei, B., Sisu, C., Frankish, A., Howald, C., Habegger, L., Mu, XJ., Harte, R., Balasubramanian, S., Tanzer, A., Diekhans, M., Reymond, A., Hubbard, TJ., Harrow, J. and Gerstein, MB. et al. (2012) ''. GENOME BIOLOGY, 13 (9). pp. R51. ISSN: 1474-760X
Sisu, C., Baron, AJ., Branderhorst, HM., Connell, SD., Weijers, CAGM., de Vries, R., Hayes, ED., Pukin, AV., Gilbert, M., Pieters, RJ., Zuilhof, H., Visser, GM. and Turnbull, WB. et al. (2009) ''. ChemBioChem, 10 (2). pp. 329 - 337. ISSN: 1439-4227
Albrecht, B., Grant, GH., Sisu, C. and Richards, WG. (2008) ''. Biophysical Chemistry, 138 (1-2). pp. 11 - 22. ISSN: 0301-4622
Pukin, AV., Branderhorst, HM., Sisu, C., Weijers, CAGM., Gilbert, M., Liskamp, RMJ., Visser, GM., Zuilhof, H. and Pieters, RJ. et al. (2007) ''. ChemBioChem, 8 (13). pp. 1500 - 1503. ISSN: 1439-4227